定义和内涵

哲学上的物质范畴：是对世界上一切现象（包括自然现象和社会现象）的根本特性的最高概括，是唯物主义哲学的基石，强调物质是世界的本原，意识是物质的产物，它不依赖于人的意识，而又为意识所反映的一切客观实在，物质范畴是一种基本存在形态，包括诸如物体、物质、能量等。

物理结构学说：物理学中关于物质结构的理论，如分子动理论、原子核式结构模型、玻尔模型、量子力学模型等，这些理论主要描述物质的微观结构和粒子行为，它们是基于科学实验和观察得出的具体结论，用于解释物质的性质和变化规律。

研究方法和角度

哲学上的物质范畴：主要运用思辨和逻辑推理的方法，从整体上把握世界的本质和规律。

物理结构学说：主要运用实验观察、数学建模和理论分析等方法，深入探究物质的微观结构及其相互作用机制。

抽象程度和应用范围

哲学上的物质范畴：具有高度的抽象性和普遍性，它适用于所有的物质现象和领域，为我们提供了一种理解世界的普遍方式。

物理结构学说：则是具体科学领域的理论，它们针对特定的物质系统或现象进行研究。

二者的联系

哲学指导科学：哲学上的物质范畴为自然科学提供了世界观和方法论的指导，帮助科学家形成正确的研究方向和思维方式。

科学推动哲学发展：自然科学的新发现和理论成果会不断丰富和发展哲学上的物质范畴，促使哲学家们对物质概念进行更深入的思考和探讨，例如现代量子力学的发展就对传统哲学的物质观念提出了挑战和新的启示。

哲学上的物质范畴与物理结构学说既有明显的区别又存在着紧密的联系，在科学研究中，我们应该充分认识到两者的不同特点并加以合理利用。