药学专业和制药工程专业存在多方面的区别，具体如下：

一、学科性质与归属

1、药学专业：通常属于医学学科门类下的药学类，侧重于医药学基础和应用知识。

2、制药工程专业：属于工学学科门类中的化工与制药类专业，更偏向于工学原理和技术在药物制备中的应用。

二、培养目标

1、药学专业：旨在培养具有扎实的药学基础理论知识和实验技能的高素质专门人才，能够从事药物化学、药物设计、药物分析、临床药学、药品研发等工作。

2、制药工程专业：培养具备制药工程学科的基本理论、基本知识和基本实验技能的高素质应用型、复合型专业人才，毕业后能够在医药、农药等领域从事工程设计、过程开发、生产管理等工作。

三、课程设置

1、药学专业：课程包括有机化学、生物化学、微生物学与免疫学、药物化学、药剂学、药理学、药物分析学、药事管理学等，强调生物学和化学特性以及药物在临床上的合理使用。

2、制药工程专业：课程有有机化学、生物化学、物理化学、化工原理、制药工程、药物合成反应、药物化学、药理学、药剂学、天然药物化学、应用光谱解析、制药工艺学等，注重化学工程原理和技术在药物生产过程中的应用。

四、就业方向

1、药学专业：毕业生可在医院药房、药物制剂室、药厂等单位从事药物制备、鉴定及临床合理用药等工作，也可在药检所从事药物的质量鉴定和制定相应的质量标准，或在医药贸易公司从事药品流通及销售等工作。

2、制药工程专业：可在医药、农药、精细化工和生物化工等部门从事医药产品的合成与工艺研究、医药产品开发、应用研究和经营管理等工作。

五、侧重点与核心关注点

1、药学专业：更注重“用药”，关注药物与人体的相互作用，如药物的治疗效果、不良反应、药物代谢等，致力于合理用药和药物治疗方案的优化。

2、制药工程专业：更注重“造药”，关注药物的研发与生产过程，包括生产工艺的设计、设备的选型、质量控制体系的建立等，以确保药物的质量和生产效率。

药学专业侧重于药物本身的基础研究和临床应用，而制药工程专业则侧重于将工程学原理应用于药物的生产过程，两个专业各有侧重，共同为医药行业的发展做出贡献。